Examinando por Autor "Sánchez Muñoz, Juan Armando"
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Publicación Acceso abierto A study of the IGS/ETS region in octocorals and black corals(Universidad de los Andes, 2008) Hernández Durán, Sonia Eleonora; Sánchez Muñoz, Juan ArmandoPublicación Acceso abierto ADN ambiental (eDNA) como método de evaluación de diversidad en ecosistemas acuáticos(Universidad de los Andes, 2018) Reyes Vargas, Laura Catalina; Sánchez Muñoz, Juan ArmandoLos profundos cambios en la distribución de las especies a lo largo de los años ha constituido uno de los campos de estudio más amplios en los últimos tiempos. La biología molecular, por su parte, ha avanzado al punto en el que su aplicabilidad puede adaptarse a muchos tipos de análisis. El ADN ambiental, o eDNA, es una técnica que permite analizar muestras de diferentes tipos de sustrato del ambiente para detectar especies o evaluar su diversidad total. Los ecosistemas acuáticos son uno de los mayores retos debido a su rango de variabilidad e inestabilidad con respecto a otros. A lo largo del análisis se exploraron ventajas y desventajas del método así como diversas aplicaciones que han revolucionado el monitoreo de biodiversidadPublicación Acceso abierto Análisis de comunidades de foraminíferos bentónicos como indicadores de calidad de agua (Foram index) en arrecifes del Caribe Colombiano(Uniandes, 2009) Velásquez Niño, Johanna; Sánchez Muñoz, Juan ArmandoPublicación Acceso abierto Análisis de escleroma para la clasificación de nueva especie de Pacifigorgia(Universidad de los Andes, 2020) Pedraza Troya, Nicolás; Sánchez Muñoz, Juan ArmandoThe Octocorales are a phylogenetic group of soft corals, little information is currently available about them. Therefore, it is common to find individuals that do not fit into any of the known species. Additionally, traditional methods for the categorization of individuals have limitations that hinder their identification. Therefore, it is necessary to promote the use of new tools that ease and complement this process. In this study, a comparison was made of the composition of the skeleton made of calcium carbonate, that presents individuals of the genus Pacifigorgia, which could not be identified with traditional methods, with the composition present in individuals of the species Pacifigorgia eximia. After reviewing the sclerome of both individuals, as well as a genetic and morphological review of both, it was possible to determine that the population in question fails to meet the necessary characteristics to enter the P. eximia species.Publicación Acceso abierto Análisis filogenético de las esponjas de agua dulce de Colombia mediante ADN mitocondrial COI(Universidad de los Andes, 2018) Chilma Arias, Andrés Felipe; Lasso Alcalá, Carlos Andrés; Sánchez Muñoz, Juan ArmandoA pesar que las esponjas dulceacuícolas son un grupo cosmopolita, los pocos trabajos realizados se basan en descripciones taxonómicas tradicionales y en aspectos ecológicos. Para el caso del neotrópico, no hay estudios enfocados en resolver la filogenia molecular de las esponjas de agua dulce. Por lo cual, en Colombia tampoco hay estudios filogenéticos reportados para esponjas de agua dulce que se basen en métodos moleculares. Por tal razón, aislar el gen mitocondrial Citocromo Oxidasa subunidad I (COI) y determinar la relación filogenética a partir de este marcador es el primer paso a realizar. Para ello, se colectaron muestras de esponjas de las tres cuencas hidrográficas más grandes de Colombia (Amazonas, Orinoco y Magdalena-Cauca) y en lagos altoandinos donde se ha confirmado la presencia de este grupo. Cada individuo colectado fue preservado en alcohol al 96% y en (DMSO) para su análisis molecular. Se logró obtener el ADN de las esponjas dulceacuícolas.Publicación Acceso abierto Analysis of the geomorphological change in Tesoro Island and its benthic community(Uniandes, 2017) Roa García, Paula Andrea; Sánchez Muñoz, Juan ArmandoPublicación Acceso abierto Antimicrobial activity of culturable microorganisms associated with Caribbean black corals (Antipatharia)(Universidad de los Andes, 2017) Peña Moreno, Daniela Valentina; Celis Ramírez, Adriana Marcela; Sánchez Muñoz, Juan ArmandoPublicación Acceso abierto Aproximación a la viabilidad de zooxantelas del género Symbiodinium spp. presentes en las heces del pez loro Sparisoma viride(Universidad de los Andes, 2013) Delgado Barrera, Angela María; Sánchez Muñoz, Juan ArmandoPublicación Acceso abierto Artificial coral-derived ceramic material: A technological development for a sustainable carbon capture system(Universidad de los Andes, 2022-02-22) Neira Ramírez, Lorena; Sánchez Muñoz, Juan Armando; Marín Castillo, Rodrigo Alberto; Madriñán Restrepo, SantiagoCoral reefs are undergoing major transitions that threaten their natural functioning and resilience. These changes may modify reef ecology and geomorphology in various ways, especially in the form of reduced topographic complexity and carbon capture capacity. In the same way, offsetting carbonate production consists of processes that erode reef framework either through dissolution or through conversion to sediment. Geologically speaking, carbonate is also added through physicochemical and biologically mediated lithification (i.e., generation of coral rubble). The invention patent (Patent No. NC2022/0000142, Patent pending) presented here, owned by the University of the Andes, allows the production of artificial porous coral probes (ceramic material) with controlled density and porosity. This study presents the manufacturing process of the ceramic material and a sintering method from a controlled mixture of coral debris aggregates, organic algal-based binders, and generators of porosity. Once the sintering and water removal process has taken place is worth heeding that one of the most important aspects of the artificial coral is the generation of a complex connected porous system that allows rapid-flux marine colonization and may facilitate biological functions enhancing carbon storage capacity. Because the mold tooling on which the sintering takes place can be of any shape and size, so can the sintered coral-derived ceramic probes and its mechanical characteristics be of a range described for stony corals including chemical-physical characteristics discussed here such as bulk, solid, and skeletal density, connected and isolated porosity, pore-size distribution, physical and chemical heterogeneity.Publicación Acceso abierto Assembling the genome of pacifigorgia irene: the quest for genomic level landmarks in gorgonian octocorals(Universidad de los Andes, 2015) Ramírez Portilla, Catalina; Reyes , Alejandro; Sánchez Muñoz, Juan Armando; Claudia, Chica; Mahdi, BelcaidPublicación Acceso abierto Assessing the genetic structure of several populations of the lace coral Stylaster roseus in the Caribbean(Universidad de los Andes, 2016) Gnecco Polanía, Mariana; Sánchez Muñoz, Juan ArmandoPublicación Acceso abierto Assessment of larval settlement under acidification conditions in the gorgonian coral pterogorgia guadalupensis (cnidaria: octocorallia)(Universidad de los Andes, 2017) Simancas Giraldo, Susana Marcela; Sánchez Muñoz, Juan Armando; 79425493; Bastidas, Carolina; Forero Shelton, Antonio Manu; Garavito Aguilar, Zayra Viviana"The study of the development and settlement of coral larvae under low pH conditions is important for understanding how corals and coral reefs will respond to ocean acidification. Here we examine larval development and settlement under acidified conditions in the gorgonian coral Pterogorgia guadalupensis (Duchassaing & Michelin 1846). Brooding events in this octocoral are described as well as subsequent larval stages until colony formation. We found reproductive events in this octocoral to be consistent with yearly bimodal distributions, possibly cued by the new moon. Coral larvae settlement was assessed under six pH conditions on coralline red algae (Hydrolithon boergesenii), and dead gorgonian axis." -- Tomado del Formato de Documento de Grado.Publicación Acceso abierto Blanqueamiento coralino: caracterización molecular de las zooxantelas asociadas en el Caribe colombiano(Universidad de los Andes, 2007) Hurtado Pérez, María Clara; Sánchez Muñoz, Juan ArmandoPublicación Acceso abierto Búsqueda de marcadores moleculares para el octocoral antropical de profundidad paragorgia arborea (linnaeus, 1758)(Uniandes, 2009) Agudelo Piñeros, Claudia Liliana; Sánchez Muñoz, Juan ArmandoPublicación Acceso abierto Caracterización de levaduras marinas y su potencial fermentador(Universidad de los Andes, 2020) Merchán Carrizosa, Laura Valentina; Sánchez Muñoz, Juan ArmandoEn Colombia la industria de la acuicultura empezó a tener fuerza desde los últimos 10 años. De manera paralela, ha aumentado el conocimiento sobre las principales enfermedades y agentes de estas infecciones en los peces (causadas por virus, bacterias, hongos y otros). Adicionalmente, se ha concluido que al agregar a la dieta de los peces levaduras con capacidad fermentadora, como Saccharomyces cerevisiae, aumenta significativamente el sistema inmune innato y adquirido de los peces disminuyendo así su mortalidad. En este estudio se aislaron e identificaron las levaduras marinas, con capacidad fermentadora, comparándolas con una cepa referencia de S. cerevisiae. De los morfotipos de levaduras aislados, se identificaron dos que fueron capaces de tener una fermentación igual o mayor a la cepa referencia. De este modo, se espera en un futuro poder evaluar su capacidad antibiótica contra patógenos frecuentes de tilapia, tales como Streptococcus agalactiae, S. iniae y Aeromonas hydrophila.Publicación Acceso abierto Caracterización de los principales factores bióticos y abióticos que influyen sobre la capacidad remoción de fenol por un Consorcio Microbiano (CM) formado por Scenedesmus dimorphus y su ficoesfera(Universidad de los Andes, 2021) Gutiérrez Fonseca, Jaime Eduardo; González Barrios, Andrés Fernando; Vives Flórez, Martha Josefina; Sánchez Muñoz, Juan Armando; Montenegro Ruiz, Luis CarlosLos consorcios microbianos (CM) están despertando mucho interés científico y biotecnológico, y entre estos, los consorcios microbianos de predominancia microalgal (CMPM) han mostrado un gran potencial para aplicaciones en producción de biomasa, energía limpia y bioremediación (Abdel-Raouf, Al-Homaidan, & Ibraheem, 2012a; Gonçalves, Pires, & Simões, 2017). El principal uso de los CMPM en la biorremediación es en el tratamiento de aguas residuales (Abdel-Raouf et al., 2012a; Gonçalves et al., 2017; Liu et al., 2017), y los géneros más reportados en este campo son Chlorella y Scenedesmus. Sin embargo, se han reportado varias otras microalgas con la capacidad de eliminar y degradar contaminantes (Abdel-Raouf et al., 2012a; Delgadillo-Mirquez, Lopes, Taidi, & Pareau, 2016). A pesar de este potencial, los costos de los productos y procesos basados en microalgas siguen siendo relativamente altos, lo que ha impedido su aplicación generalizada (De Bhowmick, Sarmah, & Sen, 2019). Los CMPM están formados por células flotantes (plantónicas) y por biopelículas cuya composición celular y capacidades metabólicas pueden variar respecto a su contraparte plantónica (Berner, Heimann, & Sheehan, 2015; Rincon, Romero, Aframehr, & Beyenal, 2017). Numerosa evidencia indica que las células del consorcio modifican sus perfiles de expresión cuando hacen parte de una biopelícula, lo cual a su vez modifica el comportamiento del consorcio (Paquette et al., 2020). Entender estos cambios, los factores que los inducen, y el efecto que estos tienen sobre las capacidades metabólicas del CMPM es esencial para poder desarrollar aplicaciones tecnológicas efectivas y eficientes (Bharti, Velmourougane, & Prasanna, 2017). En este trabajo se estudiará un CMPM formado por Scenedesmus dimorphus y las bacterias presentes en su ficoesfera, para entender como influye la formación de la biopelícula en la capacidad de este CMPM para remover fenol del medio, y caracterizar la biopelícula.Publicación Acceso abierto Caracterización eléctrica del carbonato de calcio CaCO3 para uso como sensor en la medición de bioerosión de los arrecifes coralinos(Universidad de los Andes, 2021) Martínez Zapata, María Fernanda; Nova Manosalva, Omar Ariel; Neira Ramírez, Lorena; Sánchez Muñoz, Juan Armando; Segura Quijano, Fredy Enrique; Osma Cruz, Johann FacceloEl proyecto presentado aborda el diseño e implementación de una estructura capacitiva teniendo como dieléctrico un cerámico sujeto a patente de origen sedimentario coralino. Se entrega un producto terminado con placas paralelas fabricadas con FR4 y cobre, donde el antisolder y la resina epóxica permiten que esta estructura se pueda sumergir en agua a diferentes niveles de acidez. Se realizaron mediciones de capacitancia en dos equipos, analizador de impedancias y LCR, variando los niveles de pH en agua marina para identificar y analizar diferencias entre la capacitancia medida en aire, agua de llave y agua salina. Los resultados obtenidos indican que es posible medir el desgaste, mediante diferencias capacitivas, de este compuesto sintético de carbonato de calcio (CaCO3) fabricado por los investigadores del grupo BIOMMAR de la Universidad de los Andes. Además, resulta un primer paso hacia el monitoreo eficiente, costo-efectivo y replicable de la salinidad y bioerosión como indicadores de cambio climático, específicamente enfocado en proteger las especies dependientes del CaCO3 como los son los crustáceos, moluscos, pterópodos y estructuras coralinas.Publicación Acceso abierto Caracterización molecular de las zooxantelas (symbiodinium spp.) asociadas a especies de zoantídeos (suborden macrocnemina: parazoanthus spp. y epizoanthus spp.) en el mar Caribe(Uniandes, 2007) Torres Monroy, Ingrid Lisbeth; Sánchez Muñoz, Juan ArmandoPublicación Acceso abierto Chlorella como endosimbionte, importancia, características y filogenia(Universidad de los Andes, 2020) Díaz Puerto, Laura María; Sánchez Muñoz, Juan Armando; Bernal Giraldo, Adriana Jimena; Delgado Perafán, María del Pilar; Dussán Garzón, JennyChlorella is a genus of green algae used in different industries. Through this monography we seek to summarize the importance of Chlorella, its characteristics as an endosymbiont and its phylogenetic relationships.Publicación Acceso abierto Conectividad genética a fina escala en el caribe colombiano: estructura poblacional del coral Montastraea faveolata(2013) Acuña Posada, Rocío Juliana; Sánchez Muñoz, Juan Armando