El Trastorno del Espectro Autista (TEA) es un trastorno del neurodesarrollo, el cual se caracteriza por su heterogeneidad a nivel clínico y genético. La arquitectura genética está compuesta tanto por variantes raras con alto impacto funcional como por variantes comunes de bajo efecto a lo largo de todo el genoma. Sin embargo, la mayoría de estudios genéticos se han realizado en poblaciones de origen europeo, lo que limita la comprensión del componente genético del TEA en poblaciones latinoamericanas con ancestría admixta. Por este motivo, el presente estudio tuvo como objetivo el análisis de las variantes comunes en el TEA en familias en trío de una cohorte colombiana, utilizando el Test de Desequilibrio de Transmisión (TDT).
El estudio se realizó a partir de datos de SNP array, sometidos a control de calidad, filtrado, imputación genómica y aplicación del TDT, seguido de análisis de desequilibrio de ligamiento y anotación funcional regulatoria de las variantes sobretransmitidas. Se identificaron en total 11 variantes sugestivas (p≤1x10-5), presentes en los cromosomas 7, 12, 13 y 17.
Las variantes presentes en los cromosomas 7 y 12 se hallaron cercanas a los genes THSD7A y CHST11 respectivamente, pero se consideraron outliers debido a su expresión en tejidos no neuronales. Por otra parte, las variantes ubicadas en los cromosomas 13 y 17 tuvieron mayor relevancia biológica al encontrarse en regiones regulatorias cerca a los genes DACH1 y RGS9. La evidencia funcional previa en estos genes sugiere expresión en ganglios basales del cerebro en vías dopaminérgicas y GABAérgicas importantes para procesos conductuales, alterados en la condición del TEA.
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