Examinando por Autor "Dussán Garzón, Jenny"

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    A novel bacterial-mediated method for the differentiation of Aedes spp. larvae in mixed-nursery assays and its application in the determination of vegetative Lysinibacillus sphaericus biocontrol efficiency in invasive vector eradication
    (Universidad de los Andes, 2020) Dániel Gómez, Mario Felipe; Dussán Garzón, Jenny
    The establishment of Aedes aegypti and the recent invasion of Aedes albopictus has put Colombia at risk, as it now harbours two arboviral vector species. Studies have shown the susceptibility of Aedes aegypti to the vegetative toxins produced by Lysinibacillus sphaericus. This study aims to determine the potential of two L. sphaericus strains in the control of both Aedes species present in Colombia, in both single and mixed species nurseries. Given the similarities between both species, there exists a need to differentiate them for the development of precise control strategies. Accordingly, mixed nurseries employed an mRFP-expressing Escherichia coli strain as a differentiator. Coloration-aided differentiation facilitated the analysis of mixed nursery treatments and provided deeper scrutiny into the variables at play. This showed an increase in the biocontrol efficiency, pointing to probable ecological variables. Bioassays involving Ae. albopictus showed a lower resistance to the one reported for Ae. aegypti in single-species nurseries. The study concludes that the use of E. coli strains expressing fluorescent proteins are useful tools to be employed in areas like public health entomology. Moreover, it was found that the use of L. sphaericus strains for biocontrol of vector mosquitoes is a viable alternative to chemical insecticides.
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    An explosive condition: open cast coal mining soil subsurface biodiversity and the expression of nitrogen cycle genes
    (Uniandes, 2010) Mejía Flórez, Nasmille Liceth; Dussán Garzón, Jenny
    Open coal ANFO-cast pit mines present in the Guajira state are altered daily by anthropogenic activities. Detonation and removal of the earth's layers for the exposure of coal directly alters microbial ecology. Studying deep subsurface microbial ecology and the factors that influence it is a difficult task but seeing that the environment selects the microorganisms present in a particular place and time, the influence of the ANFO explosive was questioned. Two geographically separate pits were sampled, at three different distances from the surface with different times from the last detonation. Cultivable bacteria abundance, median and standard deviation, values show no statistically significant differences between both pits, while site location did influence plate count. Diversity indexes had the expected tendencies for most sites, except recently detonated locations. At the laboratory ANFO pressures were done to evaluate the influence of the explosive on the cultivated bacteria recovered from both mines. The pressure selected39% of total cultivable bacteria, 87.5% belonging to recently altered sites and 100%the identified individuals belonging to the Pseudomonas genus. RNA extraction of ANFO treatments as the only nitrogen and carbon sources available demonstrated the expression of narG, napA and nirS genes. Expression of nirS confirms 62.5% of the selected bacteria as denitrifiers. The ANFO explosive may explain the presence and abundance of the Pseudomonas genus in recently detonated sites, altering expected diversity index values. To conclude doubts about the effect of the explosive further studies centered on real time microcosm essays are needed to evaluate differential expression of denitrification genes, along with hydrocarbon degradation genes.
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    Aproximación al escalamiento para la producción de Bacillus sphaericus : obtención de un medio de cultivo para la producción industrial
    (Uniandes, 2003) Gómez Eslava, Camila; González Barrios, Andrés Fernando; Dussán Garzón, Jenny
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    Assessment of the restriction-methylation systems as an advantage in the transformation of Lysinibacillus sphaericus III(3)7
    (Universidad de los Andes, 2019) León Castro, Diana Carolina; Dussán Garzón, Jenny
    Lysinibacillus sphaericus es una bacteria gram positiva ampliamente estudiada por sus propiedades entomopatógenas y su tolerancia a diferentes metales pesados. Sin embargo, debido a su alta conservación genómica y a la ardua transferencia horizontal de ADN foráneo, la manipulación genética de cepas de L. sphaericus con características ambientales importantes se ha ralentizado. Recientemente, se observó la presencia de diferentes sistemas de restricción-metilación en la cepa entomopatógena L. sphaericus C3-4, los cuales estarían involucrados en la regulación del material genético externo que entra a la célula y podrían actuar como una barrera que garantiza la identidad bacteriana. Ya que existe alta similaridad evolutiva entre cepas tóxicas, este estudio evaluó los sistemas de restricción-metilación de la cepa colombiana entomopatógena L. sphaericus III (3) 7 como una ventaja en su transformación con el plásmido pMK4-ampR / chlR. Primero, se encontró que los patrones de metilación de los extractos libres de células (CFE)
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    Biosurfactants produced by Lysinibacillus sphaericus during the bioremediation process show entomopathogenic activity against aedes aegypti pupae
    (Universidad de los Andes, 2020) Rincón Barrotes, Lina María; Dussán Garzón, Jenny
    "A nivel mundial, ha habido numerosos desastres ambientales debido a derrames de petróleo en las últimas décadas. La biorremediación es una excelente opción para manejar derrames de petróleo ya que es amigable con el medio ambiente, es altamente reproducible y tiene bajos costos de implementación. En Colombia, Lysinibacillus sphaericus, una bacteria grampositiva y formadora de esporas, ha demostrado la capacidad de biorremediar agua y suelos contaminados con hidrocarburos. Además, ha demostrado la habilidad de controlar biologicamente Aedes aegypti. En el proceso de bioremediación, L. sphaericus produce biosurfactantes para reducir la tensión superficial de la superficie y aumentar la disponibilidad del hidrocarburo. Además, estudios previos demostraron que los biosurfactantes producidos por L. sphaericus tienen actividad larvicida contra el Ae. aegypti. Este estudio muestra la capacidad de L. sphaericus para producir biosurfactantes a partir de una muestra de agua contaminada con hidrocarburos. Además, muestra que los biosurfactantes producidos por L. sphaericus tienen actividad entomopatógena contra Ae. aegypti pupas." -- Tomado del Formato de Documento de Grado.
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    Glyphosate concentration decreases in the soil cultivated with Alnus acuminata var. acuminata when inoculating Lysinibacillus sphaericus
    (Universidad de los Andes, 2021) Bolívar Trujillo, Claudia Alejandra; Dussán Garzón, Jenny
    En Colombia, el uso del herbicida glifosato para la erradicación de cultivos ilícitos de coca, opio y papa se ha convertido en un problema en términos de conservación de la biodiversidad, ya que estos cultivos crecen en áreas que alguna vez fueron bosques tropicales húmedos y ponen en riesgo la preservación de la vegetación nativa. El glifosato se ha convertido en una fuente de contaminación ambiental ya que tiene la capacidad de almacenarse en las estructuras de las plantas y acumularse en el suelo alcanzándolo principalmente a través de la aplicación directa o por la superficie de la planta rociada arrastrada por la lluvia, la deriva aérea, la precipitación y la exudación de las raíces. Sin embargo, Lysinibacillus sphaericus, una bacteria reportada como promotora del crecimiento de las plantas, ha demostrado la capacidad de degradación del glifosato a través de la vía de la sarcosina sin conducir a la producción de AMPA. El objetivo de este estudio fue evaluar la capacidad de Lysinibacillus sphaericus de disminuir la concentración de glifosato en un suelo cultivado con Alnus acuminata var. acuminata. Y evaluar su capacidad simultánea para promover el crecimiento de las plantas mediante la medición de variables del suelo como la concentración de amonio, nitrato y AIA; variables de salud de las plantas como la longitud de la raíz y el tallo y los metabolitos de la raíz; actividad microbiana como la concentración del título del suelo y los metabolitos del suelo. Los resultados mostraron principalmente que la concentración de glifosato y AMPA disminuye en el suelo cultivado con Alnus acuminata var. acuminata al inocular Lysinibacillus sphaericus.
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    Landfarmed oil sludge could be used as a fertilizer for jack-beans (canavalia ensiformis) implications on phytoremediation
    (Uniandes, 2009) Ramírez Guerrero, Diego Fernando; Dussán Garzón, Jenny
    The petroleum exploitation in the oilfields, especially petroleum drilling, generates an oily sludge mixed with hydrocarbons and mineral solids. This is an important waste that could generate an environmental problem. In general, these oil sludge's are treated chemically or stored in deposits. In either case, it is sometimes treated by bioremediation and phytoremediation. Some waste sludge's have been used as a fertilizer or soil additions. The objective of this study was to assess the influence of land farmed oil sludge as a fertilizer of the legume C. ensiformis in a phytoremediation assay of the TPHs remnants in this oil sludge. Also different parameters were evaluated in order to identify morphological differences of the legumes between the soil added with the oil sludge and control soil amended with humus. Since there were no differences in the plant height and leaf area between treatments during the study, it can be considered that the oil sludge does not affect the plants as a soil addition. There was a decrement of TPH levels in the soil and an accumulation of TPHs in the roots. The TPHs were not found in the aerial parts of the plants, however there were some PAHs. Endophytes of the Enterobacteriaceae family were found in the plants of the oil sludge treatment, but it could not be proved that these endophytes are involved in the remediation of these organic compounds. In future studies, it could be possible to identify the bioremediation capacity in the isolated endophytes. It is important to continue with the phytoremediation with successive crop rotation.
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    Lysinibacillus sphaericus and phosphorous levels in a sunflowers crop soils containing glyphosate
    (Universidad de los Andes, 2018) Villegas Warren, Ricardo; Dussán Garzón, Jenny
    "El glifosato es un herbicida no selectivo ampliamente utilizado en el control de malezas, cultivos genéticamente modificados y la erradicación de plantaciones ilícitas. La Agencia Internacional para la Investigación del Cáncer (IARC) considera el glifosato y su subproducto de degradación AMPA, un carcinógeno, genotóxico y capaz de producir estrés oxidativo en las células animales. La oxidación y algunas rutas metabólicas biológicas transforman el glifosato en AMPA, alternativamente, la vía sarcosina en algunos microorganismos como Pseudomonas spp. ha demostrado su capacidad para la biodegradación del glifosato, lo que resulta en glicina. Lysinibacillus sphaericus es una variable gram-bacilo formadora de esporas, que se informa que es una bacteria solubilizadora de fosfato ampliamente utilizada en aplicaciones de biorremediación. En un estudio previo, vimos la expresión del gen de sarcosina en L.sphaericus en presencia de glifosato." -- Tomado del Formato de Documento de Grado
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    Lysinibacillus sphaericus: adaptaciones moleculares como respuesta a la exposición a plomo
    (Universidad de los Andes, 2014) Bojacá Bautista, Vivian Andrea; Dussán Garzón, Jenny; Delgado Perafán, María del Pilar; Husserl Orjuela, Johana
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    Metabolic Burden assessment and incompatibility model of pMK4 within Lysinibacillus sphaercius III(3)7.
    (Universidad de los Andes, 2020) León Castro, Diana Carolina; Dussán Garzón, Jenny; Marques Martín, Sivia; Jiménez Avella, Diego Javier
    La adquisición y especialmente el mantenimiento de un plásmido generalmente conlleva un costo de aptitud que reduce la tasa de reproducción del huésped bacteriano; para cepas como Lysinibacillus sphaericus III (3) 7, que posee importantes propiedades ambientales, esta alteración junto con cambios morfológicos y tasas de esporulación reducidas pueden ejercer un efecto negativo en los estudios metabólicos utilizando plásmidos como plataformas de clonación. El objetivo de este estudio es abordar el comportamiento metabólico de las células portadoras de pMK4 de L. sphaericus III (3) 7 mediante el uso de análisis bioinformáticos e in vitro. Se construyó un modelo de incompatibilidad entre el vector pMK4 y un megaplasmido predicho, pBsph, dentro de las células III (3) 7 basándose en una región incA. Además, no se encontró estabilidad de plásmido a largo plazo in vitro en células portadoras de plásmido. Se evaluaron las alineaciones entre replicones, elementos genéticos móviles e interacciones ARN-ARN, visualización de alineación por pares, modelos gráficos y cambios morfológicos mediante SEM. El análisis de metabolitos se realizó mediante HPLC acoplado a un Q-TOF 6545, y se utilizó ionización por electropulverización, finalmente se utilizaron larvas de Aedes aegypti y Culex quinquefasciatus para la evaluación de la actividad larvicida. Los resultados encontraron una disminución en la tasa de crecimiento, reducción de la formación de esporas y cambios morfológicos, lo que apoyó la idea del costo metabólico que ejerce pMK4. Una incompatibilidad entre pMK4 y pBsph parece tener lugar dentro de las células de L. sphaericus III (3) 7, sin embargo, se necesitan más estudios in vitro para confirmarlo.
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    Role of plant growth-promoting bacteria on Phytoextraction process of Cu(II) and Cr(VI) by Helianthus annuus and Zea mays
    (Universidad de los Andes, 2011) Rojas Tapias, Daniel Fernando; Dussán Garzón, Jenny; Bonilla Buitrago, Ruth Rebeca; Rodríguez Bocanegra, María Ximena; Bernal Giraldo, Adriana Jimena
    As a result of inappropriate deposition of organic residues, toxic anthropogenic compounds have become ubiquitous components in soil and waters. Several alternatives have been developed, however, one of the most important is bioremediation. It is a low-cost, effective and environmentally friendly alternative to remediate contaminated soil. In particular, the phytoremediation of heavy metals has become an important tool to alleviate the impact occasioned by inorganic contamination with arsenic, lead, cadmium, copper or chromium, for example. We decided to evaluate the process of phytoextraction of copper by its implications in agricultural productivity and chromium by its negative effects on both human and animal health. Additionally, selected two vegetable species: maize and sunflower. With regard to maize, it is plant specie of fast-growth and high biomass, characteristics desired in a phytoremediation process. While sunflower has been widely reported and characterized by its qualities to extract several heavy metals from soil. Plant growth-promoting bacteria (PGPB) defined as microorganisms with beneficial effect on plant development, have elucidated to be a relevant strategy to improve phytoremediation process. In this study, we exhibited the role of PGPB on improvement of this biotechnological strategy. We evaluated eight bacteria and characterized them by its capacity as PGPR. Also, identified this molecularly. We demonstrated that bacterial inoculation with bacteria Pseudomonas putida GN4 and Acinetobacter sp. CC30 enhanced plant growth and the content of chlorophyll a, chlorophyll b and carotenoids in both maize and sunflower plants under copper (II) and chromium (VI) contamination. With respect to extraction process, bacterial inoculation exerted an important effect on ions mobility in soil. Furthermore, increased the availability of copper extractable from soil. Several bacterial strategies are though to influence the efficiency of phytoremediation process. Bacterial capacities to synthesize indole or siderophores, solubilize phosphate or mineralize ammonia have evidenced to influence significantly on remediation of heavy metals by plants. Hence, in summary, utilization of PGPR to improve phytoremediation process is an important alternative to reduce cost and increased remediation efficiency. Further, it is a sustainable strategy to preserve the quality of environment.